iTRAQ同位素标记相对定量和绝对定量分析
iTRAQ 采用液质联用的方法高通量地检测多组别间的蛋白质表达差异。蛋白质酶切成多肽后，用iTRAQ同位素试剂标记多肽N末端或赖氨酸侧链基团。标记后的多肽经过液相色谱分离，进行一级和二级质谱分析，在
2D + MALDI-TOF/TOF蛋白胶点鉴定服务
利用MALDI-TOF/TOF技术对双向电泳中指定的胶点（考染、银染或DIGE）或单一纯化蛋白样品进行质谱鉴定。
SILAC定量蛋白质组
2002年，丹麦Mann实验室的OngSE等对AACT技术作了进一步改进，建立了SILAC技术并首次应用于定量蛋白质组研究，为全面、系统地定性和定量分析复杂哺乳动物细胞蛋白质组提供了有效的方案。